In einer anderen Dimension, zur selben Zeit als Ash und seine Freunde in Alamos Town ankommen: Dialga und Palkia, die Herrscher von Zeit und Raum, liefern sich einen erbitterten und gnadenlosen Kampf, in dem Palkia von seinem Gegner verletzt wird und durch eines im Kampf entstandenem Loch im Raum-Zeit-Gewebe flüchten kann, um sich auszuruhen. Dazu versetzt es seinen Zufluchtsort in eine andere Dimension. Aus Zufall landet es bei Ash und Co. in Alamos, was die Bewohner der Stadt verwirrt und in Panik versetzt, da niemand aus der Stadt flüchten kann und sie wegen dem plötzlich auftretenden Nebel nichts sehen können, welcher sich selbst durch Auflockern nicht entfernen lässt. Die Bewohner der Stadt denken, dass Darkrai an allem Schuld ist. Während Palkia unauffällig versucht sich selbst zu heilen, sucht Darkrai nach ihm. Nachdem Darkrai den Standort von Palkia ausmacht...